RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANO4Q32M45 955 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 D2HGDHQ8N465 521 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 JADE3Q92613 823 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FATE1Q969F0 183 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLC2Q9H0B6 622 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEF6Q9H4E7 631 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKS1Q9NXB0 559 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPTORQ8N122 1335 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHTN1A0MZ66 631 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRP1O14786 923 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADCY6O43306 1168 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKR1B10O60218 316 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCAMP43121 646 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC5A3P53794 718 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANAPC15P60006 121 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGBP1P78318 339 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 DUSP2Q05923 314 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MALLQ13021 153 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MST1LQ2TV78 715 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUM1L1Q5H9M0 696 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZVL8 140 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 PALM2Q8IXS6 379 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR156Q8NFN8 814 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5M3Q8NGP4 307 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 EDAQ92838 391 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL8AQ96BM9 186 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 GREM2Q9H772 168 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 TUBD1Q9UJT1 453 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITGA10O75578 1167 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADRB1P08588 477 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 GYPEP15421 78 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 C5AR1P21730 350 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ODF1Q14990 250 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACAP2Q15057 778 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTPN21Q16825 1174 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 HS1BP3Q53T59 392 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPM1NQ8N819 430 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF480Q8WV37 535 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL17RAQ96F46 866 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM89AQ96GI7 184 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADOQ96SZ5 270 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZMYM3Q14202 1370 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL33A6NCF5 533 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN14A8MX76 684 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT10BO00744 389 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUSKO15146 869 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLSCR1O15162 318 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF2O75151 1096 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDUFS2O75306 463 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GASTP01350 101 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GZMKP49863 264 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT85P78386 507 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 APBA1Q02410 837 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEPT2Q15019 361 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOMO1Q15155 1222 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZRM9 215 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 REPS2Q8NFH8 660 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MDM1Q8TC05 714 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRG4Q8WWG1 115 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms