RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362449.1

RN7SKP25-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP25, Length 308 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP25-201ENST00000362449 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.51□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NRP1O14786 923 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CPLX1O14810 134 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 MSH4O15457 936 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 JAK2O60674 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 POMCP01189 267 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 LAMP2P13473 410 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RFX1P22670 979 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 TGM1P22735 817 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 STARD6P59095 220 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PRR16Q569H4 304 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 UBXN11Q5T124 520 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 B3GALT6Q96L58 329 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 DISC1Q9NRI5 854 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SAMM50Q9Y512 469 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 WDR64B1ANS9 1081 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CHMP2AO43633 222 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CTDNEP1O95476 244 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SOD2P04179 222 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CIITAP33076 1130 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RCAN1P53805 252 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 MTERF2Q49AM1 385 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 FGF14Q92915 247 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 MIOSQ9NXC5 875 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ANK1P16157 1881 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NID2Q14112 1375 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 F5P12259 2224 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 KINO60870 393 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GLUD1P00367 558 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ALDH2P05091 517 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 URODP06132 367 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ADH1AP07327 375 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SKIP12755 728 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GJB2P29033 226 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GLUD2P49448 558 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RAB27AP51159 221 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPC5P78333 572 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NTRK3Q16288 839 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PARM1Q6UWI2 310 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PALB2Q86YC2 1186 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 URGCPQ8TCY9 931 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 STAMQ92783 540 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 NELL1Q92832 810 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC5A5Q92911 643 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP25-201ENST00000362449 PHKBQ93100 1093 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms