RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 LRSAM1Q6UWE0 723 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 APBB2Q92870 758 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 CPB2Q96IY4 423 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 TSG101Q99816 390 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC25Q9H1X3 360 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 USP20Q9Y2K6 914 aa30.42■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GUA9 196 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 TGFB1I1O43294 461 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 CALUO43852 315 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ANO6Q4KMQ2 910 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 SLFN12LQ6IEE8 588 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 SEPT8Q92599 483 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC51Q96ER9 411 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ADPGKQ9BRR6 497 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA6BQ9H3T3 888 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 SCN5AQ14524 2016 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC63Q05C16 580 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 FTHL17Q9BXU8 183 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 RWDD2AQ9UIY3 292 aa30.41■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A4Q6P5W5 647 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 MPZL3Q6UWV2 235 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 TCHPQ9BT92 498 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 IKZF4Q9H2S9 585 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 PDZD7Q9H5P4 517 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa30.4■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD63C9JTQ0 380 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN3O15551 220 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 CAVIN2O95810 425 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ARMCX5Q6P1M9 558 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 FOXR2Q6PJQ5 311 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRHQ9HD43 1115 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 NR2E3Q9Y5X4 410 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 STYXL1Q9Y6J8 313 aa30.39■■■□□ 2.46
GIPC1-201ENST00000345425 PFKMP08237 780 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 GARTP22102 1010 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 PROZP22891 400 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 EDRF1Q3B7T1 1238 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZCWPW2Q504Y3 356 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 SLC27A1Q6PCB7 646 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 POMGNT1Q8WZA1 660 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CSF2RAP15509 400 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF568Q3ZCX4 644 aa30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TISP43B9A030 160 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 NFIL3Q16649 462 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD40Q6AI12 368 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 C12orf56Q8IXR9 622 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TMX1Q9H3N1 280 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TSPY26PQ9H489 355 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM49BA6NDI0 452 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 PMS1P54277 932 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 STX17P56962 302 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 MCL1Q07820 350 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.451e-6■■■■□ 21
GIPC1-201ENST00000345425 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 EEF1DP3Q658K8 133 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 BADQ92934 168 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 LTBP2Q14767 1821 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CLIC2O15247 247 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 SYN1P17600 705 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 RPL13P26373 211 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ADSSP30520 456 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 DSC3Q14574 896 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TTI2Q6NXR4 508 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CNKSR3Q6P9H4 555 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM174Q8WUU8 243 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0B4J269 797 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ABLIM1O14639 778 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 MCF2P10911 925 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 FPGSQ05932 587 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 MYBPC2Q14324 1141 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB33Q86T24 672 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 BPIFA3Q9BQP9 254 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CBWD1Q9BRT8 395 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 MSTO1Q9BUK6 570 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDT1Q9H211 546 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TET1Q8NFU7 2136 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 NR3C1P04150 777 aa30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF165P49910 485 aa30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9A9Q8IVB4 645 aa30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM2Q99965 735 aa30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-201ENST00000345425 TRAIPQ9BWF2 469 aa30.34■■■□□ 2.45
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