RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327304.9

EXOSC3-201, Transcript of exosome component 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EXOSC3, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3-201ENST00000327304 PHKA2P46019 1235 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 MAN2A1Q16706 1144 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SCLT1Q96NL6 688 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 USP20Q9Y2K6 914 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TISP43B9A030 160 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 K7ERI5 159 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 PDXKO00764 312 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CASP14P31944 242 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 EFNA5P52803 228 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 POU5F1BQ06416 359 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 VWA3BQ502W6 1294 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CEP135Q66GS9 1140 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NUP58Q9BVL2 599 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TMEM206Q9H813 350 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 GINS2Q9Y248 185 aa20.5■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 B4GALT4O60513 344 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FECHP22830 423 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CDK7P50613 346 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ZNF410Q86VK4 478 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 IQCDQ96DY2 449 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 GBP3Q9H0R5 595 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NOD1Q9Y239 953 aa20.49■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SCP2P22307 547 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 STRN3Q13033 797 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NME8Q8N427 588 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NDST4Q9H3R1 872 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 PRKCBP05771 671 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 IQCF3P0C7M6 154 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 COL6A1P12109 1028 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ABCD1P33897 745 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 PTK7Q13308 1070 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 OSMRQ99650 979 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.48■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CETN3O15182 167 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CLIC2O15247 247 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CTSHP09668 335 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CDC42EP1Q00587 391 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NFIL3Q16649 462 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 MAPK6Q16659 721 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FIGNQ5HY92 759 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 RSPH3Q86UC2 560 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 BICD1Q96G01 975 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FZD8Q9H461 694 aa20.47■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 USP27XA6NNY8 438 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 THPOP40225 353 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TERF1P54274 439 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ADAM9Q13443 819 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 RPAINQ86UA6 219 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 B4GALT5O43286 388 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NR3C1P04150 777 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 AMHR2Q16671 573 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.46■□□□□ 0.87
EXOSC3-201ENST00000327304 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms