RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 HIP1RO75146 1068 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DLG4P78352 724 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PBKQ96KB5 322 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 UGCGQ16739 394 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DAAM2Q86T65 1068 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 NIM1KQ8IY84 436 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PSMD1Q99460 953 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PNMA2Q9UL42 364 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB7AO95365 584 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MAPK7Q13164 816 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FAM84AQ96KN4 292 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF570Q96NI8 536 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 BATF3Q9NR55 127 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ATP9AO75110 1047 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PTGER2P43116 358 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DIAPH2O60879 1101 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GGT7Q9UJ14 662 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.9■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SOX10P56693 466 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 PALB2Q86YC2 1186 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 COPB2P35606 906 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.89■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 CAND2O75155 1236 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 KCNJ2P63252 427 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MTFR1LQ9H019 292 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 FEM1BQ9UK73 627 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 RIPK3Q9Y572 518 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 CHN1P15882 459 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MTMR2Q13614 643 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 SAAL1Q96ER3 474 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 TEPSINQ96N21 525 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 FLOT1O75955 427 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MMEP08473 750 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 NPEPPSP55786 919 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MTMR3Q13615 1198 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 PADI6Q6TGC4 694 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ZNF554-201ENST00000317243 NACC1Q96RE7 527 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms