RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 N4BP3O15049 544 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 GRM6O15303 877 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 CUTAO60888 179 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 EDN1P05305 212 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 KRT18P05783 430 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 NOMO2Q5JPE7 1267 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 APOL6Q9BWW8 343 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PANK2Q9BZ23 570 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 HES2Q9Y543 173 aa27.51■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SLC16A4O15374 487 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 CSPG5O95196 566 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ITGB1P05556 798 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SMTNP53814 917 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 RNF39Q9H2S5 420 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PDZD7Q9H5P4 517 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.5■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ME1P48163 572 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 GIT2Q14161 759 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 THNSL1Q8IYQ7 743 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 HACE1Q8IYU2 909 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 URGCPQ8TCY9 931 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF558Q96NG5 402 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.49■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 A0A087X0B3 334 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PBX3P40426 434 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 STAT6P42226 847 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SV2BQ7L1I2 683 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PDILTQ8N807 584 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ADPGKQ9BRR6 497 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D13Q9NVG8 400 aa27.48■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 FAM13AO94988 1023 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF131P52739 623 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SHC4Q6S5L8 630 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TAS1R3Q7RTX0 852 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SPPL3Q8TCT6 385 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 GBP3Q9H0R5 595 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ZHX3Q9H4I2 956 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PARVGQ9HBI0 331 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PRDM6Q9NQX0 595 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 KANSL3Q9P2N6 904 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.47■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TBCAO75347 108 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 FGF18O76093 207 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 AKAP5P24588 427 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 MYCT1Q8N699 235 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 GIT1Q9Y2X7 761 aa27.46■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 MYO7AQ13402 2215 aa27.45■■□□□ 1.99
CXCL2-201ENST00000296031 ARL5CA6NH57 179 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 POMCP01189 267 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJB1P25685 340 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 MLH1P40692 756 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 STRN3Q13033 797 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 POF1BQ8WVV4 589 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 GAD1Q99259 594 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PARP2Q9UGN5 583 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 H0YCG3 227 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 INPPL1O15357 1258 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PPM1AP35813 382 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 NCKAP1LP55160 1127 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 BCAR1P56945 870 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 KRT85P78386 507 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 CAMK1Q14012 370 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DYMQ7RTS9 669 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 DDX12PQ92771 950 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ZFP42Q96MM3 310 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 SPG21Q9NZD8 308 aa27.44■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.43■■□□□ 1.98
CXCL2-201ENST00000296031 MYMKA6NI61 221 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms