RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 MAP3K7O43318 606 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RAD51CO43502 376 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EVI5O60447 810 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GSTA1P08263 222 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GSTA2P09210 222 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ATF2P15336 505 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GALCP54803 685 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CREG2Q8IUH2 290 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ISCUQ9H1K1 167 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 AMACRQ9UHK6 382 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NAGPAQ9UK23 515 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 BAG2O95816 211 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PPP2R2AP63151 447 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CAVIN3Q969G5 261 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 KCND2Q9NZV8 630 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 POLLQ9UGP5 575 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 THAP12O43422 761 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MAPK4P31152 587 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 FMO5P49326 533 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CEP55Q53EZ4 464 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SGO2Q562F6 1265 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NLRP14Q86W24 1093 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MTMR8Q96EF0 704 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GMNCA6NCL1 334 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CHRNA3P32297 505 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RWDD2BP57060 319 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ELMOD1Q8N336 334 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SNX24Q9Y343 169 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ORC6Q9Y5N6 252 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ALS2Q96Q42 1657 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RASGRF2O14827 1237 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ECE2O60344 883 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MED24O75448 989 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 KRT14P02533 472 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD42Q8N9B4 389 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TLR10Q9BXR5 811 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EPN3Q9H201 632 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 UBE4BO95155 1302 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM49P0CI25 452 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM49CP0CI26 452 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ITKQ08881 620 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MGARPQ8TDB4 240 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TTC1Q99614 292 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO40Q9UH90 709 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ROBO3Q96MS0 1386 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 VAMP7P51809 220 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 CORO7P57737 925 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 HAUS1Q96CS2 278 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 EHD4Q9H223 541 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ATICP31939 592 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ABCD1P33897 745 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GCLMP48507 274 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 ARPP19P56211 112 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GUCY1A3Q02108 690 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 LXNQ9BS40 222 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 FTLP02792 175 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM253P0C7T8 217 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 NRBF2Q96F24 287 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 LRGUKQ96M69 825 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRG-201ENST00000295874 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms