RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 BSNDQ8WZ55 320 aa20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CALML4Q96GE6 196 aa20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 IGSF21Q96ID5 467 aa20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 B4GALT5O43286 388 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 GUCY2CP25092 1073 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CABP7Q86V35 215 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 GBP3Q9H0R5 595 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CD207Q9UJ71 328 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 WDR81Q562E7 1941 aa20.88■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 ARL5CA6NH57 179 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 K7ERI5 159 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NPTXRO95502 500 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 POMCP01189 267 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 VPS52Q8N1B4 723 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 GAD1Q99259 594 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RNF39Q9H2S5 420 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.87■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC169A6NNP5 214 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PER2O15055 1255 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 HIP1RO75146 1068 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CXCL14O95715 111 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 MLH1P40692 756 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SLC11A1P49279 550 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PEX3P56589 373 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 COASYQ13057 564 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA5Q96PV4 448 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 APOL6Q9BWW8 343 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PARP2Q9UGN5 583 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 HES2Q9Y543 173 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 IRAK3Q9Y616 596 aa20.86■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 LINC01565O15544 149 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 TBX10O75333 385 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DDHD2O94830 711 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PLA2G4BP0C869 781 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CTSAP10619 480 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 IL9P15248 144 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 LIG1P18858 919 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NPTX2P47972 431 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SMTNP53814 917 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 KCNK18Q7Z418 384 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 HSCBQ8IWL3 235 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.85■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 H0YCG3 227 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 NRP1O14786 923 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 MBTPS2O43462 519 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SCP2P22307 547 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 DSC1Q08554 894 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 GRIK3Q13003 919 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CASP10Q92851 521 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 ZBP1Q9H171 429 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 CLEC1BQ9P126 229 aa20.84■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 HIDE1A8MVS5 230 aa20.83■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 STX6O43752 255 aa20.83■□□□□ 0.93
MALSU1-201ENST00000287543 AKAP5P24588 427 aa20.83■□□□□ 0.93
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