RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 GBP1P32455 592 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 MFSD5Q6N075 450 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FIZ1Q96SL8 496 aa20.1■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 FAM196BA6NMK8 535 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 SREBF1P36956 1147 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TPH2Q8IWU9 490 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PARVGQ9HBI0 331 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 CHMP2AO43633 222 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 LMO3Q8TAP4 145 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 BTBD6Q96KE9 485 aa20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RTN2O75298 545 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 NFIL3Q16649 462 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 GALNTL6Q49A17 601 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 PNMA3Q9UL41 463 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.08■□□□□ 0.81
CNIH3-201ENST00000272133 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 KRT16P08779 473 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 GPC5P78333 572 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 DLG4P78352 724 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 BFSP1Q12934 665 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SLC15A2Q16348 729 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SLFN13Q68D06 897 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 VSTM1Q6UX27 236 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 DMAC2Q9NW81 257 aa20.08■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 PASKQ96RG2 1323 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 C6orf229H3BNL8 230 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 GH1P01241 217 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ALADP13716 330 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 GDAP1Q8TB36 358 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 KLHL29Q96CT2 875 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 TP73O15350 636 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 EXOC3O60645 756 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 NEBLO76041 1014 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SUN1O94901 812 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SCNN1DP51172 638 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SLC8A3P57103 927 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 BNIP1Q12981 228 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 PPP2R5AQ15172 486 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CYP1B1Q16678 543 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 DYDC2Q96IM9 177 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 AMNQ9BXJ7 453 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 DNAJC18Q9H819 358 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 AAASQ9NRG9 546 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.07■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SLITRK3O94933 977 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF76P36508 570 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 COPS2P61201 443 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 NFIAQ12857 509 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CD101Q93033 1021 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 GGPS1O95749 300 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 BCRP11274 1271 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF131P52739 623 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CALCOCO2Q13137 446 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 CERS5Q8N5B7 392 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 FITM2Q8N6M3 262 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.06■□□□□ 0.8
CNIH3-201ENST00000272133 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms