RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 ITGA2BP08514 1039 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CABP4P57796 275 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TTC16Q8NEE8 873 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CAVIN3Q969G5 261 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GTH6 734 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CFAP99D6REC4 459 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 KRT16P08779 473 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 PTPN4P29074 926 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 MESDQ14696 234 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 LONRF1Q17RB8 773 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TERB1Q8NA31 727 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 IP6K1Q92551 441 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ISCUQ9H1K1 167 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 THAP9Q9H5L6 903 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ENTPD5O75356 428 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CASP5P51878 434 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ADAM17P78536 824 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SSH3Q8TE77 659 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 HPS1Q92902 700 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SNTNA6NMZ2 147 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 LGALS16A8MUM7 142 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 H0Y626 953 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TTI1O43156 1089 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 COPB2P35606 906 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GOLGA8RI6L899 631 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF24P17028 368 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 KCNMA1Q12791 1236 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NR1I3Q14994 352 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 MAPK11Q15759 364 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GSTA3Q16772 222 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CROTQ9UKG9 612 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 STX8Q9UNK0 236 aa11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 IFNA8P32881 189 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 MXI1P50539 228 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ESR2Q92731 530 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GRM8O00222 908 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NFIBO00712 420 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TJP3O95049 919 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CHEK2O96017 543 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 PTGS2P35354 604 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 CITED4Q96RK1 184 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SPTLC1O15269 473 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 IDH3BO43837 385 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GAS7O60861 476 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GPC4O75487 556 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SERPING1P05155 500 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 IST1P53990 364 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 RAB14P61106 215 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 ADAM9Q13443 819 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 RPS6KA2Q15349 733 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 JADE1Q6IE81 842 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 PARVGQ9HBI0 331 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 GNPATO15228 680 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 NAT1P18440 290 aa11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
KPNA3-201ENST00000261667 KRT6CP48668 564 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms