RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 PRR16Q569H4 304 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 LENG9Q96B70 501 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 AGPAT1Q99943 283 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MEIS2O14770 477 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RTN2O75298 545 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 BCRP11274 1271 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC16A2P36021 539 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 DCAF4Q8WV16 495 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SLCO2A1Q92959 643 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 DMAC2Q9NW81 257 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SIPA1L1O43166 1804 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MEIS1O00470 390 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RSPH10BP0C881 870 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SREBF1P36956 1147 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 NCALDP61601 193 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MYBPC2Q14324 1141 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM196BA6NMK8 535 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM13AO94988 1023 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RARAP10276 462 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 GPC5P78333 572 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 BNIP1Q12981 228 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 BANK1Q8NDB2 785 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 COPB2P35606 906 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 PEX5P50542 639 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 KCTD1Q719H9 257 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 VAV3Q9UKW4 847 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 UBOX5O94941 541 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 GJB6O95452 261 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MUTP22033 750 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 COPS2P61201 443 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MYL7Q01449 175 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 WHRNQ9P202 907 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ANP32DO95626 131 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CALCOCO2Q13137 446 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TTC27Q6P3X3 843 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 MKL1Q969V6 931 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 PARVGQ9HBI0 331 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 KCND2Q9NZV8 630 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 P4HA2O15460 535 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNA1Q09470 495 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ECT2Q9H8V3 914 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 SMIM23A6NLE4 172 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 POTEJP0CG39 1038 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CBWD6Q4V339 395 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 CD101Q93033 1021 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-201ENST00000215941 YDJCA8MPS7 323 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 TCEA3O75764 348 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP3A4P08684 503 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 GZMAP12544 262 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FGFR4P22455 802 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO1EQ12965 1108 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 ACCSLQ4AC99 568 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 MYCT1Q8N699 235 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 AMNQ9BXJ7 453 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC19Q9H756 370 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-201ENST00000215941 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms