RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm31yQ9D3U4 565 aa11.04□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sv2aQ9JIS5 742 aa11.04□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm28036V9GXJ1 658 aa11.04□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plcg1Q62077 1302 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Osbpl9A2A8Z1 736 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dhtkd1A2ATU0 921 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkkE9Q7N4 1118 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Alkbh1P0CB42 389 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ly9Q01965 654 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc39dQ0VF76 604 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trip13Q3UA06 432 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rint1Q8BZ36 792 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctage5Q8R311 779 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdha2Q91Y17 948 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr3fQ921X6 316 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tas1r3Q925D8 858 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdca7Q9D0M2 382 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpap3Q9D706 660 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nudt12Q9DCN1 462 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mta2Q9R190 668 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Skor2A7M7C7 1008 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnnc1P19123 161 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp4P35123 962 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FancbQ5XJY6 703 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zdhhc24Q6IR37 284 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ublcp1Q8BGR9 318 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd6Q8BNL5 237 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Epc2Q8C0I4 808 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp37Q8C0R0 979 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbx22Q8K402 517 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrbp2Q91V36 499 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps36Q91XD6 386 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prmt2Q9R144 448 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam22Q9R1V6 904 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnip1Q9WUU8 647 aa11.03□□□□□ -0.64
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r15L7N2A0 855 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gsg1l2M0QWL6 290 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rfc1P35601 1131 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AdalQ80SY6 360 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pak2Q8CIN4 524 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lgi2Q8K4Z0 550 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgd4Q91ZT5 766 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pex5O09012 639 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf18O35714 228 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MafgO54790 162 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01734 135 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdc25cP48967 447 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LipeP54310 759 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo1fP70248 1099 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem63bQ3TWI9 832 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sestd1Q80UK0 696 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hsdl1Q8BTX9 330 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wrap53Q8VC51 532 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc8Q8VD72 515 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Glis2Q8VDL9 521 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Emc2Q9CRD2 297 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PorcnQ9JJJ7 461 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grk1Q9WVL4 564 aa11.02□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FlgP11088 336 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgat1P27808 447 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VegfaQ00731 214 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adamts18Q4VC17 1219 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abi3bpQ59IW6 1179 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttyh3Q6P5F7 524 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srrm3Q80WV7 648 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dph5Q9CWQ0 281 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Capn9Q9D805 690 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DgkhD3YXJ0 1156 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stk10O55098 966 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ChkbO55229 394 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Epha3P29319 983 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp11aP98197 1187 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EsrrbQ61539 433 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anks6Q6GQX6 883 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ssxb10Q6XAR7 170 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plppr4Q7TME0 766 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8BGD0 127 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scgb2b20Q9JI02 112 aa11.01□□□□□ -0.65
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gyg1Q9R062 333 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.7 ms