RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C PEX6P33760 1030 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C YBR241CP38142 488 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C YEL068CP39977 110 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C IRC5P43610 853 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C UFD1P53044 361 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C TWF1P53250 332 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C MEP3P53390 489 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C YPR127WQ06494 345 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C YPR196WQ06595 470 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C YLR413WQ06689 675 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C RPN6Q12377 434 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C SAS5Q99314 248 aa3.03□□□□□ -1.92
SUP53tL(CAA)C MET3P08536 511 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YHR212W-AP0CX91 67 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C RHB1P25378 209 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YCL002CP25565 263 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YOX1P34161 385 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C JEN1P36035 616 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C CCZ1P38273 704 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YGL235WP53071 178 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GET1P53192 235 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YNL181WP53878 407 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GTR1Q00582 310 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C VPS36Q06696 566 aa3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C OPI3P05375 206 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C DSF1P0CX08 502 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YNR073CP0CX09 502 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C CMK2P22517 447 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SNC1P31109 117 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ARC19P33204 171 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C PPZ2P33329 710 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YKL071WP36086 256 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YKR015CP36111 568 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C PEX32P38292 413 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C RMD6P39975 231 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MET28P40573 187 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YFL054CP43549 646 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GON7P46984 123 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C NUP57P48837 541 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YDC1Q02896 317 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C HED1Q03937 162 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C BNA7Q04066 261 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C KRE28Q04431 385 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SOR2Q07786 357 aa3.01□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C RAS1P01119 309 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C HTA1P04911 132 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ARG3P05150 338 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C TPK2P06245 380 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MRPS28P21771 286 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C CPR2P23285 205 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GSH1P32477 678 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C HBS1P32769 611 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ECM15P35195 104 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YKL077WP36081 392 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C SRO77P38163 1010 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YBR032WP38223 100 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ALP1P38971 573 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ATF1P40353 525 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YIL166CP40445 542 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C GCN20P43535 752 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C IMD4P50094 524 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C VPS60Q03390 229 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C CAC2Q04199 468 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C DLT1Q04216 342 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YDR514CQ04408 483 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YLR281CQ05863 155 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MCH4Q08268 501 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C FCY1Q12178 158 aa3□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MRS3P10566 314 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C ENA1P13587 1091 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C DEG1P31115 442 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C TOA1P32773 286 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MCH2P36032 473 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.99□□□□□ -1.93not detected
SUP53tL(CAA)C ARN1P38731 627 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C AIM46P38885 310 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C TIF11P38912 153 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C DDI1P40087 428 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C NTA1P40354 457 aa2.99□□□□□ -1.93
SUP53tL(CAA)C YFL015CP43578 164 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.7 ms