RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640500.1

GABRG2-223, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit, human

TSL 5

Gene GABRG2, Length 2,849 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRG2-223	ENST00000640500	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ANK1	P16157	1881 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	RCCD1	A6NED2	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	LAD1	O00515	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ENPP3	O14638	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	EYA4	O95677	639 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CA3	P07451	260 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CUL4B	Q13620	913 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	GIT2	Q14161	759 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	HYI	Q5T013	277 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ERMN	Q8TAM6	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ADAM2	Q99965	735 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	SPTLC1	O15269	473 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	TSPAN1	O60635	241 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PPP6R2	O75170	966 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DGAT1	O75907	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	YEATS4	O95619	227 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	NPTX2	P47972	431 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	KRT85	P78386	507 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PAK2	Q13177	524 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	IER5	Q5VY09	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	HERVK_113	Q902F9	699 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	MAP7D2	Q96T17	732 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	APOL6	Q9BWW8	343 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CCDC169	A6NNP5	214 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	MAGEB2	O15479	319 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CD46	P15529	392 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	AKAP5	P24588	427 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	BMP8B	P34820	402 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	STAT6	P42226	847 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CDR1	P51861	262 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PRSS12	P56730	875 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	OSTN	P61366	133 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	KLK14	Q9P0G3	267 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	CUTA	O60888	179 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	NR1I2	O75469	434 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	LINC00271	P0C7V0	271 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	MYB	P10242	640 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DNAJB2	P25686	324 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	WNT7B	P56706	349 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	SPAG1	Q07617	926 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	PDE4C	Q08493	712 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	DSC3	Q14574	896 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	GRIN2C	Q14957	1233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GABRG2-223	ENST00000640500	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms