RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MSRA	Q9UJ68	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	C3	P01024	1663 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ID4	P47928	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CTSW	P56202	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	NFKB2	Q00653	900 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	NFYC	Q13952	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	DGKD	Q16760	1214 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	FERMT3	Q86UX7	667 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PTPRK	Q15262	1439 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	LAMTOR5	O43504	91 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	STAT4	Q14765	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	KANK1	Q14678	1352 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	B4GALT4	O60513	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	FAP	Q12884	760 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	NCOA1	Q15788	1441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ADGRL2	O95490	1459 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	PZP	P20742	1482 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	TNR	Q92752	1358 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	GPR39	O43194	453 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	OPHN1	O60890	802 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MEOX1	P50221	254 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	LPP	Q93052	612 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	KDM1A	O60341	852 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ANTXR2	P58335	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RELT	Q969Z4	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MTG2	Q9H4K7	406 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MED17-223	ENST00000640077	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ROCK1	Q13464	1354 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ABCC3	O15438	1527 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	ITGB3	P05106	788 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	PFKM	P08237	780 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	MRE11	P49959	708 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MED17-223	ENST00000640077	STAT5B	P51692	787 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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