RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636868.1

ATRX-222, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-222	ENST00000636868	RGS3	P49796	1198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	NHLH2	Q02577	135 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SCAP	Q12770	1279 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DDB1	Q16531	1140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DYDC2	Q96IM9	177 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868		Q96MF0	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	FOXB1	Q99853	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	MARCH11	A6NNE9	402 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DAPK3	O43293	454 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	MTSS1	O43312	755 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	FGFR1	P11362	822 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	REST	Q13127	1097 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868		Q6ZNX1	250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SYT12	Q8IV01	421 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC66	A2RUB6	948 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SDHA	P31040	664 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ETFDH	Q16134	617 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	NSMF	Q6X4W1	530 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	GJB6	O95452	261 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	ITPKB	P27987	946 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DNM2	P50570	870 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DOK3	Q7L591	496 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	DPH6	Q7L8W6	267 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	XYLT1	Q86Y38	959 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	VPS33B	Q9H267	617 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATRX-222	ENST00000636868		B4E1Z4	1266 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	CDKL5	O76039	1030 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	PRL	P01236	227 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	SPATA31D3	P0C874	917 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	SLC6A3	Q01959	620 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	C14orf37	Q86TY3	774 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	ING3	Q9NXR8	418 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	WWOX	Q9NZC7	414 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	ARVCF	O00192	962 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	AQP7	O14520	342 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	NRP1	O14786	923 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	FXN	Q16595	210 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	AWAT2	Q6E213	333 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	USP43	Q70EL4	1123 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	DLG3	Q92796	817 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	GSTA4	O15217	222 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	CASR	P41180	1078 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	ROM1	Q03395	351 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATRX-222	ENST00000636868	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.69	□□□□□ -1.82

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