RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ64 194 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQD8 194 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 GFRA3O60609 400 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 WEE2P0C1S8 567 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 GNA11P29992 359 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 BLIDQ8IZY5 108 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A5Q92911 643 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.89■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 H0Y858 1186 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R2N6 131 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTLC2O15270 562 aa26.88■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 ADALQ6DHV7 355 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.88■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 CLIC4Q9Y696 253 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTBN4Q9H254 2564 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 STK38Q15208 465 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 BICD2Q8TD16 824 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 RIT2Q99578 217 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALT3O60512 393 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL14O95715 111 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 ASGR2P07307 311 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 EPCAMP16422 314 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 LPPQ93052 612 aa26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 MTHFRP42898 656 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF445P59923 1031 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST12Q9NRB3 414 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 DACT1Q9NYF0 836 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 SFNP31947 248 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF21Q96ID5 467 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WZ62 844 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS7O60861 476 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 GALTP07902 379 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ME1P48163 572 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 JAK3P52333 1124 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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