RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 MAPK7Q13164 816 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 VSIG1Q86XK7 387 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 SP8Q8IXZ3 490 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 MREGQ8N565 214 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 KIFAP3Q92845 792 aa14.84□□□□□ -0.03
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HPS1-215ENST00000613394 PARP2Q9UGN5 583 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-215ENST00000613394 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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HPS1-215ENST00000613394 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.83□□□□□ -0.03
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HPS1-215ENST00000613394 VCPKMTQ9H867 229 aa14.83□□□□□ -0.03
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HPS1-215ENST00000613394 STK24Q9Y6E0 443 aa14.83□□□□□ -0.03
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HPS1-215ENST00000613394 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.83□□□□□ -0.04
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HPS1-215ENST00000613394 TMED2Q15363 201 aa14.82□□□□□ -0.04
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HPS1-215ENST00000613394 CD302Q8IX05 232 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 USP20Q9Y2K6 914 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 CEP83Q9Y592 693 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 ECE2O60344 883 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 KRT17Q04695 432 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 MYO1EQ12965 1108 aa14.81□□□□□ -0.04
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