RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597777.1

FARP1-222, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

Gene FARP1, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-222	ENST00000597777	CD58	P19256	250 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GGCX	P38435	758 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777		Q3C1V9	767 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ITGB5	P18084	799 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NUMB	P49757	651 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ZBED6	P86452	979 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	FSTL1	Q12841	308 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GRB10	Q13322	594 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777		F5H423	210 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NR3C2	P08235	984 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TRIM14	Q14142	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MTR	Q99707	1265 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TISP43	B9A030	160 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	IVL	P07476	585 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	EDNRB	P24530	442 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	RPA1	P27694	616 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	DYNLT1	P63172	113 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MTMR1	Q13613	665 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GLG1	Q92896	1179 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PIK3R2	O00459	728 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	SLC16A4	O15374	487 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	PEX10	O60683	326 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	TOMM70	O94826	608 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NPEPPS	P55786	919 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	NFASC	O94856	1347 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ICAM3	P32942	547 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FARP1-222	ENST00000597777	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71

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