RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	MTMR8	Q96EF0	704 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LAMA4	Q16363	1823 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	POM121C	A8CG34	1229 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	POTEC	B2RU33	542 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GNPAT	O15228	680 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ACADS	P16219	412 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MSH2	P43246	934 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FMO5	P49326	533 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGAP4	P98171	946 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM160B2	Q86V87	743 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SCFD2	Q8WU76	684 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CEP95	Q96GE4	821 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NCAN	O14594	1321 aa		3.78	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	USP17L5	A8MUK1	530 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790		E9PMD0	336 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NMT2	O60551	498 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC22	O60826	627 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SPAG6	O75602	509 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CAMTA2	O94983	1202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	INHBA	P08476	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CYP2D6	P10635	497 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RASA1	P20936	1047 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CA4	P22748	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ALDH1B1	P30837	517 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PRELP	P51888	382 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ARL4C	P56559	192 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	CDR2	Q01850	454 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ICA1	Q05084	483 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF543	Q08ER8	600 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TMED2	Q15363	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	BAP1	Q92560	729 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	APBB2	Q92870	758 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	COA1	Q9GZY4	146 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	EHD2	Q9NZN4	543 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NARF	Q9UHQ1	456 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	MCM8	Q9UJA3	840 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C4A	P0C0L4	1744 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	C4B	P0C0L5	1744 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMP1-216	ENST00000592790	POTEB3	A0JP26	581 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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