RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ADAM2	Q99965	735 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CIT	O14578	2027 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ANK1	P16157	1881 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759		A0A1W2PPC1	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ACKR2	O00590	384 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ABLIM1	O14639	778 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PRKCB	P05771	671 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CASP5	P51878	434 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	UBE2H	P62256	183 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	COASY	Q13057	564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759		A0A1B0GUA9	196 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TRAK2	O60296	914 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	EFCAB14	O75071	495 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	IDE	P14735	1019 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GAP43	P17677	238 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	EFNA5	P52803	228 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ASIC1	P78348	528 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	GTF2B	Q00403	316 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	AMPD3	Q01432	767 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	DPYD	Q12882	1025 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759		K7ERI5	159 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MYB	P10242	640 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	AXL	P30530	894 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	HOXD13	P35453	343 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	NUBP1	P53384	320 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	RABGGTB	P53611	331 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	KCNA1	Q09470	495 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	MAPK6	Q16659	721 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.78	□□□□□ -0.2
POP4-213	ENST00000592759	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2

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