RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	LXN	Q9BS40	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	BUB1	O43683	1085 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAD17	O75943	681 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLITRK3	O94933	977 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	FSHR	P23945	695 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	LMAN1	P49257	510 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	NPEPPS	P55786	919 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	JAM2	P57087	298 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	JAG1	P78504	1218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	GHRHR	Q02643	423 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PTK2	Q05397	1052 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	TLR10	Q9BXR5	811 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RGL1	Q9NZL6	768 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408		A0A087X0T9	212 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408		K7ENM7	598 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	P4HA2	O15460	535 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSF2BP	O75031	334 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM228B	P0C875	321 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RSPH10B	P0C881	870 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLRC1	P26715	233 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	HOXD13	P35453	343 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SOX5	P35711	763 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	FMO5	P49326	533 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	JAK3	P52333	1124 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	HVCN1	Q96D96	273 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACCS	Q96QU6	501 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	STK33	Q9BYT3	514 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	NCAN	O14594	1321 aa		10	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408		A6NNZ2	444 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408		F8VZ95	297 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLIC2	O15247	247 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAPK13	O15264	365 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	TGFB1I1	O43294	461 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	NCK2	O43639	380 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	EXOC3	O60645	756 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	HIP1R	O75146	1068 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	LYPLA2	O95372	231 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACTN1	P12814	892 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC9A1	P19634	815 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	SFN	P31947	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABCD1	P33897	745 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81	6e-6	■■■■□ 21.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K10	Q02779	954 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPFIA1	Q13136	1202 aa		9.99	□□□□□ -0.81
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms