RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TISP43B9A030 160 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A4O15374 487 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A4O43511 780 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HBP1O60381 514 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EDN1P05305 212 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2C9P11712 490 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFR4P22455 802 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRA2P23416 452 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX3P56589 373 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TYRO3Q06418 890 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNA1Q09470 495 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 STK4Q13043 487 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGA7Q13683 1181 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MORC3Q14149 939 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 UNC13DQ70J99 1090 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF180Q86T96 592 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCT1Q8N699 235 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF214Q8ND24 703 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 WHAMMQ8TF30 809 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-CQ95604 372 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMC5Q96C12 935 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM167AQ96KS9 214 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MED15Q96RN5 788 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CUEDC2Q9H467 287 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC1Q9NV70 894 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH11P35749 1972 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EVPLQ92817 2033 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35F4A4IF30 521 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC169A6NNP5 214 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GCNT3O95395 438 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SGPL1O95470 568 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSHP09668 335 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MUTP22033 750 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCY2CP25092 1073 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXD13P35453 343 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PRCPP42785 496 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP12P59046 1061 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX3-2P78367 333 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPSQ13938 189 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ODR4Q5SWX8 454 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf31Q8N865 590 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP4Q96MN2 994 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FIZ1Q96SL8 496 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF24Q9UPV7 400 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GINS2Q9Y248 185 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.66□□□□□ -1.34
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