RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ACKR2O00590 384 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF623O75123 536 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ERLIN2O94905 339 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RAB30Q15771 203 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 MAPK6Q16659 721 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 UBXN11Q5T124 520 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 A0A1B0GUA9 196 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 PPP1R37O75864 691 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM13AO94988 1023 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 PRKCBP05771 671 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 DNAJB2P25686 324 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SYKP43405 635 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RAB27AP51159 221 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 EHHADHQ08426 723 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 NOTUMQ6P988 496 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 FSIP1Q8NA03 581 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RAD9AQ99638 391 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 STRA6Q9BX79 667 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SZT2Q5T011 3432 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 H0YCG3 227 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 B4GALT5O43286 388 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 DGKIO75912 1065 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 GAP43P17677 238 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 AMPD3Q01432 767 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 LONRF3Q496Y0 759 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 DYMQ7RTS9 669 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 RNF19AQ9NV58 838 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC16A4O15374 487 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 TRAK2O60296 914 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 EOMESO95936 686 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 PIGRP01833 764 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 MYL1P05976 194 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 STAG3L1P0CL83 205 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SKIP12755 728 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCD1P33897 745 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 PBX2P40425 430 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 SMTNP53814 917 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 LRCH3Q96II8 777 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 INSL6Q9Y581 213 aa20.58■□□□□ 0.89
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC169A6NNP5 214 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 K7ERI5 159 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ABLIM1O14639 778 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 LINC00271P0C7V0 271 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PROZP22891 400 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 RABGGTBP53611 331 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 GTF2BQ00403 316 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 SFR1Q86XK3 245 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 STAMQ92783 540 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TRANK1O15050 2925 aa20.57■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 N4BP3O15049 544 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 INPPL1O15357 1258 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 TLL1O43897 1013 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 UNC13DQ70J99 1090 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 MYCT1Q8N699 235 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CNNM3Q8NE01 707 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 HVCN1Q96D96 273 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PAGE5Q96GU1 130 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 CPB2Q96IY4 423 aa20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HDGFL2-201ENST00000587016 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms