RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580103.6

NSRP1-208, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-208	ENST00000580103	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NSRP1-208	ENST00000580103	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SKI	P12755	728 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	EPCAM	P16422	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ITIH3	Q06033	890 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	EPHA7	Q15375	998 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	WNT7A	O00755	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	INPPL1	O15357	1258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SLITRK3	O94933	977 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RFC5	P40937	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RAB27A	P51159	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	AMHR2	Q16671	573 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	LXN	Q9BS40	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	LYPLA2	O95372	231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	LARGE1	O95461	756 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	BRD1	O95696	1058 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	AVPR2	P30518	371 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	MTHFR	P42898	656 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NR5A1	Q13285	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	MIOS	Q9NXC5	875 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CARNS1	A5YM72	827 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	NRP1	O14786	923 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	ASAP2	O43150	1006 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	MAP3K13	O43283	966 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	PAPLN	O95428	1278 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NSRP1-208	ENST00000580103	CLCN4	P51793	760 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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