RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-208ENST00000578446 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 SQORQ9Y6N5 450 aa11.72□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 KAT6AQ92794 2004 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 SYCE3A1L190 88 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 ACKR2O00590 384 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PSMA7O14818 248 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 B4GALT5O43286 388 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 TSPAN1O60635 241 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 NBNO60934 754 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 SYN1P17600 705 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PPP1R2P41236 205 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 LIG4P49917 911 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 STX1AQ16623 288 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 FAM187BQ17R55 369 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 SEPT8Q92599 483 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 KCNN1Q92952 543 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 STRA6Q9BX79 667 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 FZD8Q9H461 694 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 TMEM206Q9H813 350 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 PADI3Q9ULW8 664 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.71□□□□□ -0.53
USP22-208ENST00000578446 CCDC192P0DO97 292 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CSF2RAP15509 400 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 BMP6P22004 513 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ITGB8P26012 769 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PRCPP42785 496 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 NLRP12P59046 1061 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 KCNA1Q09470 495 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 AMHR2Q16671 573 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 MFSD5Q6N075 450 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ZPBP2Q6X784 338 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 MLKLQ8NB16 471 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ANO10Q9NW15 660 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 DACH1Q9UI36 760 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 USP20Q9Y2K6 914 aa11.7□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 N4BP3O15049 544 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PIGRP01833 764 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PFKMP08237 780 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 AXLP30530 894 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 FPGSQ05932 587 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TYRO3Q06418 890 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.9
USP22-208ENST00000578446 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 NOTUMQ6P988 496 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ADSSL1Q8N142 457 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 APBB2Q92870 758 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 BADQ92934 168 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CCDC51Q96ER9 411 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CPB2Q96IY4 423 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TCHPQ9BT92 498 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 GBP3Q9H0R5 595 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.69□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 TOM1L1O75674 476 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CXCL10P02778 98 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 EDN1P05305 212 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 HOXD13P35453 343 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 PAK1Q13153 545 aa11.68□□□□□ -0.54
USP22-208ENST00000578446 GPNMBQ14956 572 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms