RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-206	ENST00000563597	LAD1	O00515	517 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PTGDR	Q13258	359 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PDIA5	Q14554	519 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	URGCP	Q8TCY9	931 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CD207	Q9UJ71	328 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	GJB2	P29033	226 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CLUL1	Q15846	466 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	DUSP6	Q16828	381 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	MCTP1	Q6DN14	999 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	RSAD1	Q9HA92	442 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	AMHR2	Q16671	573 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	TMC7	Q7Z402	723 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	GJD3	Q8N144	294 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM169	Q96HH4	297 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PER2	O15055	1255 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	MBTPS2	O43462	519 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	GLP2R	O95838	553 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	PADI6	Q6TGC4	694 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CSRNP2	Q9H175	543 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CD320	Q9NPF0	282 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	CLEC1B	Q9P126	229 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-206	ENST00000563597	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597		H3BQV1	296 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	EYA4	O95677	639 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	CYP11B2	P19099	503 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	PRPH	P41219	470 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	COASY	Q13057	564 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	CPB2	Q96IY4	423 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	IPP	Q9Y573	584 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	C5orf42	Q9H799	3197 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	GALT	P07902	379 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ITGA4	P13612	1032 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	HIDE1	A8MVS5	230 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ZP2	Q05996	745 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ECM1	Q16610	540 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	HACE1	Q8IYU2	909 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	GBP3	Q9H0R5	595 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597		A0A1B0GUA9	196 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	INPPL1	O15357	1258 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	B4GALT5	O43286	388 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	NAMPT	P43490	491 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC11A1	P49279	550 aa		27.47	■■□□□ 1.99

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