RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787		K7ESF4	209 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MFAP3L	O75121	409 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCND1	P24385	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SELENOP	P49908	381 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDK17	Q00537	523 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAREM2	Q75VX8	874 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MKS1	Q9NXB0	559 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBE2QL1	A1L167	161 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MATN2	O00339	956 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOXS1	O43638	330 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GYPE	P15421	78 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	EFEMP1	Q12805	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787		Q8TCH9	128 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ORAI2	Q96SN7	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLC2	Q9H0B6	622 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCAN	O14594	1321 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PR48	441 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MUSK	O15146	869 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAST	P01350	101 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADRB1	P08588	477 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ICAM4	Q14773	271 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MUM1	Q2TAK8	710 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MTMR8	Q96EF0	704 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CEP89	Q96ST8	783 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	VTA1	Q9NP79	307 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	AKR1B10	O60218	316 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNAT2	P19087	354 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR3	P46089	330 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PER3	P56645	1201 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBE3C	Q15386	1083 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	EDA	Q92838	391 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GREM2	Q9H772	168 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SHTN1	A0MZ66	631 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL33	A6NCF5	533 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CAPN14	A8MX76	684 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVK-21	P61565	698 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	FOXL1	Q12952	345 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACAP2	Q15057	778 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CMIP	Q8IY22	773 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR156	Q8NFN8	814 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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