RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PLCB3Q01970 1234 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UBE3AQ05086 875 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KRT79Q5XKE5 535 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCNK18Q7Z418 384 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PGBD4Q96DM1 585 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLDND1Q9NY35 253 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRIP11Q15643 1979 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LINC01565O15544 149 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EYA4O95677 639 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BCAR1P56945 870 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADAM15Q13444 863 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NOTUMQ6P988 496 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TLR9Q9NR96 1032 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPG21Q9NZD8 308 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNM3Q9UQ16 869 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCOR1O75376 2440 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TTC28Q96AY4 2481 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FSCN2O14926 492 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCK2O43639 380 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 B4GALT3O60512 393 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITGA4P13612 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NRIP1P48552 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BRAPQ7Z569 592 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC51Q96ER9 411 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PNMA5Q96PV4 448 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FZD8Q9H461 694 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RSAD1Q9HA92 442 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LZTS1Q9Y250 596 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HES2Q9Y543 173 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IPPQ9Y573 584 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A1B0GUA9 196 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TNFRSF10AO00220 468 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DDHD2O94830 711 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SYT1P21579 422 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPM1AP35813 382 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NAMPTP43490 491 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KRT17Q04695 432 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HYIQ5T013 277 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CNNM3Q8NE01 707 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PLIN2Q99541 437 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 APOL6Q9BWW8 343 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GBP3Q9H0R5 595 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MIOSQ9NXC5 875 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 USP20Q9Y2K6 914 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PER2O15055 1255 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TBX10O75333 385 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NPTXRO95502 500 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POMCP01189 267 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EDN1P05305 212 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GALTP07902 379 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IL9P15248 144 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LIG1P18858 919 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDCP20941 246 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC11A1P49279 550 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM187BQ17R55 369 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms