RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 AXLP30530 894 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 RBM10P98175 930 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 CAPSQ13938 189 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 RABEP1Q15276 862 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 AGMOQ6ZNB7 445 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 ERMNQ8TAM6 284 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 TSPAN1O60635 241 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 USO1O60763 962 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 TRAPPC10P48553 1259 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 RSAD1Q9HA92 442 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 MED24O75448 989 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 ALADP13716 330 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 GLRA2P23416 452 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 NOTUMQ6P988 496 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 CNNM3Q8NE01 707 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 NACC1Q96RE7 527 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 LRFN3Q9BTN0 628 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 GBP3Q9H0R5 595 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
TTC7B-202ENST00000553948 GPR37L1O60883 481 aa35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 NCLP19338 710 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC51Q96ER9 411 aa35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 NFKBIZQ9BYH8 718 aa35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 GALTP07902 379 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 MBTD1Q05BQ5 628 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 KCNC3Q14003 757 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 IGSF21Q96ID5 467 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 KANSL3Q9P2N6 904 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJB4Q9UDY4 337 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 C5orf42Q9H799 3197 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 C2orf71A6NGG8 1288 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 ST18O60284 1047 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 RPA1P27694 616 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 LLGL2Q6P1M3 1020 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 POTEGQ6S5H5 508 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 MCPH1Q8NEM0 835 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 CPB2Q96IY4 423 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 UBN1Q9NPG3 1134 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 C11orf16Q9NQ32 467 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 FAM86C2PA6NEL3 165 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 DCXO43602 365 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 ITGA4P13612 1032 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 CA8P35219 290 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 MAEAQ7L5Y9 396 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF280BQ86YH2 543 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 VPS52Q8N1B4 723 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 CSRNP2Q9H175 543 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 IPPQ9Y573 584 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 CXCL14O95715 111 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 SLC11A1P49279 550 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 AMHR2Q16671 573 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD54Q6NXT1 300 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 GPRC5CQ9NQ84 441 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 KIF3AQ9Y496 699 aa35.84■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 NBR1Q14596 966 aa35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 HAUS3Q68CZ6 603 aa35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 C4orf32Q8N8J7 132 aa35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 ZBP1Q9H171 429 aa35.83■■■■□ 3.33
TTC7B-202ENST00000553948 LRRIQ4A6NIV6 560 aa35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 B4GALT3O60512 393 aa35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 DDHD2O94830 711 aa35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF35A5YM69 484 aa35.81■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 POMCP01189 267 aa35.81■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 MUTP22033 750 aa35.81■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 ALDH2P05091 517 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 CTSAP10619 480 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 GIT2Q14161 759 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 PADI6Q6TGC4 694 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM87AQ8NBN3 555 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 SUSD6Q92537 303 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 CASP10Q92851 521 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM175Q9BSA9 504 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC7B-202ENST00000553948 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms