RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCAIQ8N9R8 606 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT8Q9NY28 637 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8RI6L899 631 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC27A2O14975 620 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PFDN6O15212 129 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CDK8P49336 464 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 BFSP1Q12934 665 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CALCOCO2Q13137 446 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HLFQ16534 295 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RMDN1Q96DB5 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 AK8Q96MA6 479 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 INTUQ9ULD6 942 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GDF11O95390 407 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GH2P01242 217 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB8P50452 374 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MYCT1Q8N699 235 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TEX19Q8NA77 164 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TLK1Q9UKI8 766 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C3P01024 1663 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DENND3A2RUS2 1198 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RSPH10BP0C881 870 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 BCRP11274 1271 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDR1Q08345 913 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 APOBRQ0VD83 1088 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SPP2Q13103 211 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MAP2K5Q13163 448 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R5CQ13362 524 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FERMT3Q86UX7 667 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 IFT20Q8IY31 132 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCYL1Q96KG9 808 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF146Q9NTX7 359 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYM6O95789 1325 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC3O43617 180 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GH1P01241 217 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FOSL2P15408 326 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCND1P24385 295 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CIITAP33076 1130 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 ANGPT1Q15389 498 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FAM83AQ86UY5 434 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FANCBQ8NB91 859 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC42Q96M95 316 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MED10Q9BTT4 135 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CABYRO75952 493 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 VAV2P52735 878 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FSCBQ5H9T9 825 aa6.71□□□□□ -1.33
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