RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 FAM3CQ92520 227 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 CASD1Q96PB1 797 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 RGS18Q9NS28 235 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 C9IYK1 514 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 SGSM2O43147 1006 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 RFPL2O75678 378 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 FGRP09769 529 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 FSHRP23945 695 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 FAM189BP81408 668 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 LMAN2Q12907 356 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 PTGDRQ13258 359 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 ELF2Q15723 593 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 IER5Q5VY09 327 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 DNASE1L2Q92874 299 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-225ENST00000551253 ZFHX3Q15911 3703 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TSPY2A6NKD2 308 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 HOXA2O43364 376 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ORC4O43929 436 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 MGEA5O60502 916 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 HOXC13P31276 330 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NOVP48745 357 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NT5C2P49902 561 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.118e-6■■□□□ 13.7
CS-225ENST00000551253 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 KCTD1Q719H9 257 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 DCAF4Q8WV16 495 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 IWS1Q96ST2 819 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ADAM2Q99965 735 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 KXD1Q9BQD3 176 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TRIM4Q9C037 500 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 STX8Q9UNK0 236 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ATMQ13315 3056 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 DENND3A2RUS2 1198 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PATE3B3GLJ2 98 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ZNF213O14771 459 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 CDC45O75419 566 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 GGPS1O95749 300 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 BCAR1P56945 870 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 HAND2P61296 217 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 RHDQ02161 417 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 LRRC32Q14392 662 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 FGF13Q92913 245 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 STK24Q9Y6E0 443 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 KAT6AQ92794 2004 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 FLNCQ14315 2725 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PTPRBP23467 1997 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 MYH6P13533 1939 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 M0QZ92 97 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 SORBS3O60504 671 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 NMT2O60551 498 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 ECI2O75521 394 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 PTH1RQ03431 593 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-225ENST00000551253 CCDC96Q2M329 555 aa8.12□□□□□ -1.11
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