RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CTNNB1P35222 781 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZXDAP98168 799 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PRKCEQ02156 737 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PPP2R5CQ13362 524 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MSS51Q4VC12 460 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TTC38Q5R3I4 469 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ERMP1Q7Z2K6 904 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RDM1Q8NG50 284 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 MTMR9Q96QG7 549 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 IGFLR1Q9H665 355 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TLR9Q9NR96 1032 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RGL1Q9NZL6 768 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CD207Q9UJ71 328 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 LINC01565O15544 149 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 STBD1O95210 358 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TECP42680 631 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PSMC5P62195 406 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 EPHA7Q15375 998 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 BRICD5Q6PL45 260 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 RSPH3Q86UC2 560 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 TPH2Q8IWU9 490 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 METTL13Q8N6R0 699 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 DYDC2Q96IM9 177 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-217ENST00000550044 CACNA1BQ00975 2339 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 A0A087WWV3 80 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 ZBTB39O15060 712 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 GRM6O15303 877 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 AVPR2P30518 371 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CLCN1P35523 988 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 NDUFV1P49821 464 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CYP4A11Q02928 519 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 SIGLEC14Q08ET2 396 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 MTERF2Q49AM1 385 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 XKR3Q5GH77 459 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 FAM26DQ5JW98 314 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 SNX21Q969T3 373 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 FAM167AQ96KS9 214 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 GINS2Q9Y248 185 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 KAT6AQ92794 2004 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 COL1A2P08123 1366 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 PRR23AA6NEV1 266 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CAND2O75155 1236 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 SLITRK3O94933 977 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 C22orf31O95567 290 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 OR52Z1P0C646 297 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 GHRP10912 638 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 ID4P47928 161 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 TRAPPC10P48553 1259 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CLCN3P51790 818 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 NPEPPSP55786 919 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 MGAT3Q09327 533 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 IER5Q5VY09 327 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 PLA2G4FQ68DD2 849 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 ANO5Q75V66 913 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 FERMT3Q86UX7 667 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 HSCBQ8IWL3 235 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 NME8Q8N427 588 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 PROB1E7EW31 1015 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 M0QZ92 97 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-217ENST00000550044 MAGEB2O15479 319 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms