RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.17□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 GH1P01241 217 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 SMPD1P17405 629 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 USP8P40818 1118 aa9.17□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 ARHGAP1Q07960 439 aa9.17□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.16□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 ADCY6O43306 1168 aa9.16□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 LCTP09848 1927 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 EDN1P05305 212 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 TNNI1P19237 187 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 KLRC1P26715 233 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 RFC5P40937 340 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 PTK2Q05397 1052 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 CRHR2Q13324 411 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 NFIL3Q16649 462 aa9.15□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.15□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 MYH11P35749 1972 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 A0A087X0T9 212 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 H3BRB1 525 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 VTNP04004 478 aa9.15□□□□□ -0.94
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CS-215ENST00000549143 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 MAGEA1P43355 309 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 RTP1P59025 263 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-215ENST00000549143 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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