RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 AK8Q96MA6 479 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PLVAPQ9BX97 442 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 FZD8Q9H461 694 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.64□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 HOXA2O43364 376 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 OFD1O75665 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PLA2G4BP0C869 781 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 IRS1P35568 1242 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 UBA7P41226 1012 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 RAB27AP51159 221 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PEX3P56589 373 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 TFF2Q03403 129 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ARSHQ5FYA8 562 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NOTUMQ6P988 496 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 LRRC43Q8N309 656 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 DEPTORQ8TB45 409 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 KIFAP3Q92845 792 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 P2RX5Q93086 422 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 IPPQ9Y573 584 aa14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 A0A1B0GUA9 196 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 FGF18O76093 207 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NPTXRO95502 500 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PRKCBP05771 671 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SKIP12755 728 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 AXLP30530 894 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NPTX2P47972 431 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 MCM6Q14566 821 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SLC39A14Q15043 492 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PTPROQ16827 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 POF1BQ8WVV4 589 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 APOL6Q9BWW8 343 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.62□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CCDC169A6NNP5 214 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 F13A1P00488 732 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 LAG3P18627 525 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 GUCY2CP25092 1073 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PPP2R5AQ15172 486 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 FAM187BQ17R55 369 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PGBD4Q96DM1 585 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CALML4Q96GE6 196 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 IFT74Q96LB3 600 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 RSAD1Q9HA92 442 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 MIOSQ9NXC5 875 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 MYO7AQ13402 2215 aa14.61□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 A0A087X0B3 334 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SLC16A4O15374 487 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 DDHD2O94830 711 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 POMCP01189 267 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ITGA4P13612 1032 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 AKAP5P24588 427 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 MLH1P40692 756 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 BCAR1P56945 870 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 ERVFC1P60507 584 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 MAPK6Q16659 721 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.6□□□□□ -0.07
TPCN1-211ENST00000548465 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms