RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 KRT1P04264 644 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HSPA6P17066 643 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYO1EQ12965 1108 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TNFAIP1Q13829 316 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HGSNATQ68CP4 663 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 LMNB2Q03252 620 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CNPY4Q8N129 248 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CAND2O75155 1236 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MSH2P43246 934 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PMS2P54278 862 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 RWDD2BP57060 319 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC30A10Q6XR72 485 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCYL1Q96KG9 808 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM37O94972 964 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMEM206Q9H813 350 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MT-ND3P03897 115 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 RSPH10BP0C881 870 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ECM1Q16610 540 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 QPCTQ16769 361 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 RGL1Q9NZL6 768 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 EVI5O60447 810 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 CPP00450 1065 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SEPT6Q14141 434 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 PPP2R5AQ15172 486 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 RPAINQ86UA6 219 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 NACA2Q9H009 215 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 H0YCG3 227 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SH3BP5O60239 455 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 GABPAQ06546 454 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC51AQ86UW1 340 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCNYQ8ND76 341 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 MCUQ8NE86 351 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 REEP2Q9BRK0 252 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 YY1AP1Q9H869 796 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 FGRP09769 529 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZBTB33Q86T24 672 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 C4AP0C0L4 1744 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 C4BP0C0L5 1744 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 KIF1AQ12756 1690 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 OPLAHO14841 1288 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 CYP11B2P19099 503 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 GRAPQ13588 217 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 PASD1Q8IV76 773 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 CD209Q9NNX6 404 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SUFUQ9UMX1 484 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZBTB5O15062 677 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 ELF1P32519 619 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCTRP47872 440 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC29A2Q14542 456 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 TAF11Q15544 211 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-207ENST00000543470 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms