RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 WHRNQ9P202 907 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 ALPK3Q96L96 1907 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQ27 194 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQ64 194 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQC6 194 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQD8 194 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 KLRK1P26718 216 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 GIPRP48546 466 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 POU4F1Q01851 419 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 VMACQ2NL98 169 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 LCE5AQ5TCM9 118 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 GREM2Q9H772 168 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 KIF16BQ96L93 1317 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CACNA1FO60840 1977 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 TCEAL1Q15170 157 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 DLGAP5Q15398 846 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CERS5Q8N5B7 392 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 GPRASP2Q96D09 838 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 TDO2P48775 406 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF6Q15052 776 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BICRALQ6AI39 1079 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 ADCY4Q8NFM4 1077 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 OPTNQ96CV9 577 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PWWP2AQ96N64 755 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CRBNQ96SW2 442 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PRO3102Q9H379 93 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SWAP70Q9UH65 585 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 AOX1Q06278 1338 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQH9 124 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CLRN2A0PK11 232 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BICDL2A1A5D9 508 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 MYO1BO43795 1136 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 TACR1P25103 407 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PPP2R5DQ14738 602 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 KLHL33A6NCF5 533 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 AURKAO14965 403 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 IGKV5-2P06315 115 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CASQ1P31415 396 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 L1CAMP32004 1257 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 GNPTABQ3T906 1256 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CFAP100Q494V2 611 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 ICE2Q659A1 982 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BORCS6Q96GS4 357 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 VEZTQ9HBM0 779 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CD209Q9NNX6 404 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 EPHX1P07099 455 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 SETSIPP0DME0 302 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 VDRP11473 427 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 BDNFP23560 247 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 LIMS1P48059 325 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-212ENST00000535535 GJA8P48165 433 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms