RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533915.5

CMTM1-218, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 899 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-218ENST00000533915 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.49■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 FZD8Q9H461 694 aa15.49■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.49■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.49■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.49■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.48■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 ZNF365Q70YC5 407 aa15.47■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.47■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 GPT2Q8TD30 523 aa15.47■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 BMP8BP34820 402 aa15.46■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 PPP1R2P41236 205 aa15.46■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 EHHADHQ08426 723 aa15.46■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 STIM1Q13586 685 aa15.46■□□□□ 0.07
CMTM1-218ENST00000533915 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 HERVK_113Q902F9 699 aa15.46■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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CMTM1-218ENST00000533915 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 AMHR2Q16671 573 aa15.45■□□□□ 0.06
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CMTM1-218ENST00000533915 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.45■□□□□ 0.06
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CMTM1-218ENST00000533915 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 FIZ1Q96SL8 496 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 RGS18Q9NS28 235 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 TNFSF13BQ9Y275 285 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.45■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 ENPP3O14638 875 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 TOM1L1O75674 476 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 PPP1R37O75864 691 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 MYBP10242 640 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 KYAT1Q16773 422 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.44■□□□□ 0.06
CMTM1-218ENST00000533915 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.44■□□□□ 0.06
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