RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 MGEA5O60502 916 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN1O60635 241 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PRKCBP05771 671 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNJ6P48051 423 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SFR1Q86XK3 245 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC51Q96ER9 411 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAM2Q99965 735 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 DACT1Q9NYF0 836 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 KINO60870 393 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 AMHP03971 560 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM189BP81408 668 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 GTF2BQ00403 316 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 EHHADHQ08426 723 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 COASYQ13057 564 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC9A7Q96T83 725 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GUA9 196 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 C9IYK1 514 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 K7ENM7 598 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 CASP1P29466 404 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 DPYDQ12882 1025 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 STRN3Q13033 797 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ALCAMQ13740 583 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 POSTNQ15063 836 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 NOTUMQ6P988 496 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 STRA6Q9BX79 667 aa18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A0U1RQF3 1178 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 B4GALT5O43286 388 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 KLRC4O43908 158 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PPP1R37O75864 691 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SKIP12755 728 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 DEFB103AP81534 67 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 TOP1MTQ969P6 601 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 HVCN1Q96D96 273 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 TBX20Q9UMR3 447 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3-210ENST00000533686 N4BP3O15049 544 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF623O75123 536 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PRR29P0C7W0 189 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB27AP51159 221 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PSMD2Q13200 908 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZPBP2Q6X784 338 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CPB2Q96IY4 423 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GCNT3O95395 438 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EOMESO95936 686 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PIGRP01833 764 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EDN1P05305 212 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 STAG3L1P0CL83 205 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNB1Q14721 858 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 LRIT3Q3SXY7 679 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 UBXN11Q5T124 520 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC1Q9NV70 894 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MYH11P35749 1972 aa18.07■□□□□ 0.48
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