RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 BSNDQ8WZ55 320 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 LPPQ93052 612 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 DRC1Q96MC2 740 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 KIFC3Q9BVG8 833 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 APOL6Q9BWW8 343 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 C2orf40Q9H1Z8 148 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RWDD3Q9Y3V2 267 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SPTLC2O15270 562 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 B4GALT5O43286 388 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPAN1O60635 241 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SKIP12755 728 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 GPM6BQ13491 265 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ADGRE1Q14246 886 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC39A14Q15043 492 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NOTUMQ6P988 496 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 GPBP1Q86WP2 473 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 HELQQ8TDG4 1101 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 EPSTI1Q96J88 318 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SAMD11Q96NU1 681 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ZHX3Q9H4I2 956 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM105AQ9NUU6 356 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0U1RQF3 1178 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SFI1A8K8P3 1242 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC26A4O43511 780 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKCBP05771 671 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NAMPTP43490 491 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PEX3P56589 373 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 MCM6Q14566 821 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 MAPK6Q16659 721 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 GLB1LQ6UWU2 654 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 USP49Q70CQ1 688 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 THNSL1Q8IYQ7 743 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC43Q8N309 656 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RAD54LQ92698 747 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PGBD4Q96DM1 585 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PANK2Q9BZ23 570 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 GBP3Q9H0R5 595 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 KMT5AQ9NQR1 393 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 AAASQ9NRG9 546 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 COL4A6Q14031 1691 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NPTXRO95502 500 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 EOMESO95936 686 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 AXLP30530 894 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 BMPR1AP36894 532 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 STAT6P42226 847 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 ME1P48163 572 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 EFNA5P52803 228 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM189BP81408 668 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PTPROQ16827 1216 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 CLLU1OSQ5K130 101 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 HYIQ5T013 277 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 HACE1Q8IYU2 909 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PDILTQ8N807 584 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 URGCPQ8TCY9 931 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 HCSTQ9UBK5 93 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 MYO7AQ13402 2215 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC16A4O15374 487 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R37O75864 691 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM13AO94988 1023 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 YEATS4O95619 227 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 ITGA4P13612 1032 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 SMTNP53814 917 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC12A3P55017 1021 aa12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
UBASH3B-208ENST00000533451 POU5F1BQ06416 359 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms