RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532612.5

BCO2-215, Transcript of beta-carotene oxygenase 2, human

TSL 1 (best)

Gene BCO2, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCO2-215	ENST00000532612	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ENPP3	O14638	875 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	AMH	P03971	560 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	SMTN	P53814	917 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	UBE2H	P62256	183 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MAPK6	Q16659	721 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	AMHR2	Q16671	573 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	USP25	Q9UHP3	1055 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612		K7ERI5	159 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	EFCAB14	O75071	495 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	GCNT3	O95395	438 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	NPTXR	O95502	500 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MYB	P10242	640 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	GATM	P50440	423 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	CASP5	P51878	434 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	EFNA5	P52803	228 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	STRN3	Q13033	797 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	PNOC	Q13519	176 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	DSC3	Q14574	896 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	BICD1	Q96G01	975 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	SLC9A7	Q96T83	725 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	COL4A6	Q14031	1691 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BCO2-215	ENST00000532612	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	VCAN	P13611	3396 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	MYOG	P15173	224 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	GAP43	P17677	238 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	COL9A1	P20849	921 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	PBX2	P40425	430 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	POSTN	Q15063	836 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	NOTUM	Q6P988	496 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	ZBTB33	Q86T24	672 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	LPP	Q93052	612 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	FZD8	Q9H461	694 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.39	□□□□□ -0.43
BCO2-215	ENST00000532612	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.39	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms