RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.62■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TRAK2O60296 914 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 PRR29P0C7W0 189 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 KLRC1P26715 233 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 AFMP43652 599 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 FOXK2Q01167 660 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CUL4BQ13620 913 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 EDAQ92838 391 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 WNT8BQ93098 351 aa18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 KLRC4O43908 158 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 ARL2P36404 184 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 PTGISQ16647 500 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 EPC2Q52LR7 807 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SERINC5Q86VE9 423 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CAGE1Q8TC20 777 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TCP11Q8WWU5 503 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACS1-208ENST00000529677 DRC1Q96MC2 740 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.6■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 EVPLQ92817 2033 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 MYH11P35749 1972 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TREHO43280 583 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 MBTPS2O43462 519 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 HIP1RO75146 1068 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CASP1P29466 404 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 CHMP4BP1P59074 171 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 PNOCQ13519 176 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 IER5Q5VY09 327 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 UNC13DQ70J99 1090 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 RPAINQ86UA6 219 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.59■□□□□ 0.57
PACS1-208ENST00000529677 TMEM221A6NGB7 291 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 H3BNC9 293 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 M0R296 226 aa18.58■□□□□ 0.56
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PACS1-208ENST00000529677 GAP43P17677 238 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ASIC1P78348 528 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CLUL1Q15846 466 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DYMQ7RTS9 669 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 KCNN1Q92952 543 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CLDND1Q9NY35 253 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.58■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TBX10O75333 385 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 SMC2O95347 1197 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RSPH10BP0C881 870 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TMOD1P28289 359 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DNM2P50570 870 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PTK7Q13308 1070 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 DRP2Q13474 957 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 KCNB1Q14721 858 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 CAMK4Q16566 473 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TMEM143Q96AN5 459 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 GSDMAQ96QA5 445 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PARVGQ9HBI0 331 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 NOD1Q9Y239 953 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.57■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ASAP2O43150 1006 aa18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 TBCAO75347 108 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 RHOBTB3O94955 611 aa18.56■□□□□ 0.56
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