RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 LONRF3Q496Y0 759 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 GPBP1Q86WP2 473 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DRC1Q96MC2 740 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ADAM2Q99965 735 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 TMX1Q9H3N1 280 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 RGS18Q9NS28 235 aa16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 GPR32O75388 356 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF131P52739 623 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DRP2Q13474 957 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 KANK3Q6NY19 840 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 TMEM143Q96AN5 459 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 TTC3P53804 2025 aa16.29■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 MYMKA6NI61 221 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NCK2O43639 380 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 LIG1P18858 919 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 MCM4P33991 863 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 GPC3P51654 580 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 KCNQ1P51787 676 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 MAPK7Q13164 816 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 GIT2Q14161 759 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF410Q86VK4 478 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 FAM228AQ86W67 206 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DAW1Q8N136 415 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NLRP7Q8WX94 980 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DDX12PQ92771 950 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 P2RX5Q93086 422 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PAGE5Q96GU1 130 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 REEP2Q9BRK0 252 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 TRIM9Q9C026 710 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.28■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 HIP1RO75146 1068 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NR1I2O75469 434 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PPP2R5AQ15172 486 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 CNNM3Q8NE01 707 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 KCNN1Q92952 543 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 AAASQ9NRG9 546 aa16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
BRMS1-204ENST00000525127 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 NCOR1O75376 2440 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 C9IYK1 514 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 HOXA2O43364 376 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 MGEA5O60502 916 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 LINC00271P0C7V0 271 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 SCP2P22307 547 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 GLRA2P23416 452 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 NAMPTP43490 491 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 TFDP1Q14186 410 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 EVPLQ92817 2033 aa16.26■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.25■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.25■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.25■□□□□ 0.19
BRMS1-204ENST00000525127 GRM6O15303 877 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms