RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517982.1

PTDSS1-204, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-204ENST00000517982 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 ADSSL1Q8N142 457 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 WNT8BQ93098 351 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 GBP3Q9H0R5 595 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 FZD8Q9H461 694 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 TSPY26PQ9H489 355 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.53□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.52□□□□□ -0.08
PTDSS1-204ENST00000517982 PDXKO00764 312 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 EVI5O60447 810 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PPP1R37O75864 691 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 RAG1P15918 1043 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 MGAT3Q09327 533 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PAK1Q13153 545 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PAK2Q13177 524 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 NELFBQ8WX92 580 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 DPF3Q92784 378 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TCHPQ9BT92 498 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 STRA6Q9BX79 667 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.52□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 N4BP3O15049 544 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TIMP1P01033 207 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 IQCF3P0C7M6 154 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 GHRP10912 638 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 BMP6P22004 513 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CCNE1P24864 410 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 RFC2P35250 354 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF445P59923 1031 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 LRRC63Q05C16 580 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 NOTUMQ6P988 496 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ZPBP2Q6X784 338 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM199Q8N511 208 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 P2RX5Q93086 422 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CHST12Q9NRB3 414 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TBX21Q9UL17 535 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 SMTNL1A8MU46 457 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 BECN2A8MW95 431 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 KIAA0355O15063 1070 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CLDN3O15551 220 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CCL23P55773 120 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TPM4P67936 248 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TOM1L1O75674 476 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PIGRP01833 764 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FGFR4P22455 802 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CYP2C18P33260 490 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF165P49910 485 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 KCNA1Q09470 495 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 LPIN1Q14693 890 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 KYAT1Q16773 422 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CENPPQ6IPU0 288 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FAM228AQ86W67 206 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 SEPT8Q92599 483 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 APBB2Q92870 758 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 CCDC51Q96ER9 411 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.49□□□□□ -0.09
PTDSS1-204ENST00000517982 PADI3Q9ULW8 664 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms