RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 CEP72Q9P209 647 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 XDHP47989 1333 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 NEMP1O14524 444 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 DGCR2P98153 550 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 CRHR2Q13324 411 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PR48 441 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 CLSTN1O94985 981 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 PEX11BO96011 259 aa7.34□□□□□ -1.23
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PDE4D-221ENST00000514231 MASP1P48740 699 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 MAN2A2P49641 1150 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 SCNN1GP51170 649 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 SESN3P58005 492 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 Q6ZRM9 215 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-221ENST00000514231 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.34□□□□□ -1.23
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PDE4D-221ENST00000514231 ID4P47928 161 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 RABGGTBP53611 331 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 STRN3Q13033 797 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 TUBA3CQ13748 450 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 PDCD1Q15116 288 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 HTR3DQ70Z44 454 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 UBR7Q8N806 425 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 GPR87Q9BY21 358 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.32□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 ST8SIA2Q92186 375 aa7.32□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.32□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 CT83Q5H943 113 aa7.31□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.31□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF202O95125 648 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-221ENST00000514231 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 MRIQ9BWK5 157 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 TMX1Q9H3N1 280 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 LPLP06858 475 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 GYPEP15421 78 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-221ENST00000514231 GZMKP49863 264 aa7.28□□□□□ -1.24
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