RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC1BQ9P126 229 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBTPS2O43462 519 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN1O60635 241 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PBX3P40426 434 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COASYQ13057 564 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTGDRQ13258 359 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LONRF3Q496Y0 759 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOTUMQ6P988 496 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMC7Q7Z402 723 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB34Q9BZG1 259 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSAD1Q9HA92 442 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PER2O15055 1255 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALTP07902 379 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP11B2P19099 503 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMHR2Q16671 573 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 URGCPQ8TCY9 931 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM169Q96HH4 297 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSRNP2Q9H175 543 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLP2RO95838 553 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA4P13612 1032 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPHP41219 470 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNC3Q14003 757 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBR1Q14596 966 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLUL1Q15846 466 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEGQ6S5H5 508 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PADI6Q6TGC4 694 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGSF21Q96ID5 467 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK39Q9UEW8 545 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GUA9 196 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIDE1A8MVS5 230 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INPPL1O15357 1258 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH2P05091 517 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJB2P29033 226 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZP2Q05996 745 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IPPQ9Y573 584 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRAK3Q9Y616 596 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIT2Q14161 759 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECM1Q16610 540 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM187BQ17R55 369 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCTP1Q6DN14 999 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF280BQ86YH2 543 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPB2Q96IY4 423 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FZD8Q9H461 694 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BQV1 296 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDHD2O94830 711 aa18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms