RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	KPNA6	O60684	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	LTF	P02788	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT15	P19012	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	HMGA2	P52926	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	GRIN1	Q05586	938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	TUSC3	Q13454	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	TECPR2	O15040	1411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	MET	P08581	1390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAJC6	O75061	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KNG1	P01042	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACVRL1	P37023	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	LMF1	Q96S06	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439		H0Y858	1186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNK3	O14649	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CUTA	O60888	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	F2	P00734	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	GJA4	P35212	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOX5	P35711	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q8TCH9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACOT7	O00154	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	CSF2RB	P32927	897 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCNN1B	P51168	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PFKP	Q01813	784 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	DSG1	Q02413	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	SEC23A	Q15436	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q8N1X5	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBR7	Q8N806	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTPN18	Q99952	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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