RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PPP1R37O75864 691 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PTGISQ16647 500 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 EPC2Q52LR7 807 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CAVIN3Q969G5 261 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BICD1Q96G01 975 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CEP170P1Q96L14 293 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KLC4Q9NSK0 619 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 IQCDQ96DY2 449 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TBC1D12O60347 775 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 LCA5LO95447 670 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 GALCP54803 685 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BFSP1Q12934 665 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 RPS6KA1Q15418 735 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MTERF2Q49AM1 385 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 WDR78Q5VTH9 848 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NLRX1Q86UT6 975 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PXMP2Q9NR77 195 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DONSONQ9NYP3 566 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ATP2C2O75185 946 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NR3C2P08235 984 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 H2AFZP0C0S5 128 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SCP2P22307 547 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 C2CD6Q53TS8 623 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 H2AFVQ71UI9 128 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CEP57Q86XR8 500 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 IQCKQ8N0W5 287 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 F8VZ95 297 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CFAP221Q4G0U5 840 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SEZ6Q53EL9 994 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PEX26Q7Z412 305 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 RIT2Q99578 217 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PAGR1Q9BTK6 254 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CNTN2Q02246 1040 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 VPS36Q86VN1 386 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 IFT20Q8IY31 132 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BSNDQ8WZ55 320 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DENND3A2RUS2 1198 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ADRB2P07550 413 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BMT2Q1RMZ1 405 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 AADACL2Q6P093 401 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CHUKO15111 745 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PJA2O43164 708 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ITGA4P13612 1032 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TNFAIP3P21580 790 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 BACE1P56817 501 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 CPNE8Q86YQ8 564 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SLC40A1Q9NP59 571 aa17.99■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PTPRAP18433 802 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 SOX5P35711 763 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ITIH3Q06033 890 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 ANO5Q75V66 913 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 VAMP7P51809 220 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.98■□□□□ 0.47
PFKL-211ENST00000498841 MOB2Q70IA6 237 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms