RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.22□□□□□ -1.41
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDHXO00330 501 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXN1O15353 648 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSCAN12O43309 604 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A27O95847 323 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDGFAP04085 211 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 COPB2P35606 906 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP11P51784 963 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 HERVK_113P62684 666 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CBX1P83916 185 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRIN1Q05586 938 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SREBF2Q12772 1141 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRM1Q13255 1194 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 AP3B2Q13367 1082 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF174Q15697 407 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SGO2Q562F6 1265 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPECC1Q5M775 1068 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC38Q5R3I4 469 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TREML2Q5T2D2 321 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST13Q8NET6 341 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FERMT2Q96AC1 680 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAF1Q9H063 256 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSRNP2Q9H175 543 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMX1Q9H3N1 280 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 OGFRQ9NZT2 677 aa6.21□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PASKQ96RG2 1323 aa6.21□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 BTBD19C9JJ37 291 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 LAD1O00515 517 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP2A1O14983 1001 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP6O43182 974 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAX4O43316 350 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF18P17022 549 aa6.2□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTMR3Q13615 1198 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2SQ16763 222 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 INF2Q27J81 1249 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 LETM2Q2VYF4 491 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR78Q5VTH9 848 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 XKR5Q6UX68 686 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSMFQ6X4W1 530 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEK8Q86SG6 692 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBCKQ8TEA7 893 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX58Q96C10 678 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.2□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF208Q9H0X6 261 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACAD9Q9H845 621 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF146Q9NTX7 359 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM260Q9NX78 707 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.2□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 OTOFQ9HC10 1997 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR64B1ANS9 1081 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEIS2O14770 477 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 STX10O60499 249 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLFN14P0C7P3 912 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CES1P23141 567 aa6.19□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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