RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 SFI1A8K8P3 1242 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 C5orf67F2Z3F1 127 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 CUTAO60888 179 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDIT3P35638 169 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPTX2P47972 431 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAPK6Q16659 721 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 LONRF3Q496Y0 759 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABI1Q8IZP0 508 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 HELQQ8TDG4 1101 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 LPPQ93052 612 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 C17orf75Q9HAS0 396 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFAP45Q9UL16 551 aa19.71■□□□□ 0.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A1B0GUA9 196 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 H3BNC9 293 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRKCBP05771 671 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 LIG1P18858 919 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 EFNA5P52803 228 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 RRAGBQ5VZM2 374 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PGBD4Q96DM1 585 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 HCSTQ9UBK5 93 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 STK17AQ9UEE5 414 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 A0A087X0B3 334 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACKR2O00590 384 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 EDN1P05305 212 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 RB1P06400 928 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLS3P13797 630 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPM6BQ13491 265 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAALADL2Q58DX5 795 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC27A1Q6PCB7 646 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 REEP2Q9BRK0 252 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLVAPQ9BX97 442 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PANK2Q9BZ23 570 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CWH43Q9H720 699 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 KMT5AQ9NQR1 393 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP20Q9Y2K6 914 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 IPPQ9Y573 584 aa19.69■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 K7ERI5 159 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPTXRO95502 500 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHC4Q6S5L8 630 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC43Q8N309 656 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNNM3Q8NE01 707 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPIRE2Q8WWL2 714 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 RCOR1Q9UKL0 485 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 N4BP3O15049 544 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC16A4O15374 487 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 OFD1O75665 1012 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITGA4P13612 1032 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 ME1P48163 572 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 GIT2Q14161 759 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 GLB1LQ6UWU2 654 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDILTQ8N807 584 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 P2RX5Q93086 422 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDZD7Q9H5P4 517 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM134Q9H6X4 195 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 LMCD1Q9NZU5 365 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCNG1Q9UIX4 513 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 HES2Q9Y543 173 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 STAT6P42226 847 aa19.66■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMTNP53814 917 aa19.66■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRT85P78386 507 aa19.66■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 NT5DC1Q5TFE4 455 aa19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms